maanantai 25. marraskuuta 2013

IBS-etäisyydet

Excel-taulukko (Excel 2007 tai uudempi versio) sisältäen projektin jäsenten ja viiteväestönäytteiden IBS-etäisyydet on ladattavissa täältä .

IBS-lukema kertoo yhteisen SNP-arvokannan suuruuden.  Etäisyydet on laskettu edellisten tulosten lailla LD-karsitun aineston pohjalta, joten lukemat eivät vastaa suuruusluokaltaan perusdatan (Raw data) pohjalta laskettuja lukemia.  LD-karsinta poistaa genomissa esiintyvää toisteisuutta.   LD-toisteisuuteen vaikuttaa verrattavien yhteisen genomiosuuden ikä.  Teen myöhemmin tämän IBS-datan pohjalta tilastoja, joten Excelin opiskelu ei ole välttämätöntä.     

Ei kommentteja:

Lähetä kommentti

English preferred, because readers are international.

No more Anonymous posts. Do not act like folks on poorly moderated forums.